Відділ епідеміологічного нагляду (спостереження) та профілактики інфекційних хвороб
Відділ антибіотикорезистентності та інфекційного контролю
Відділ епідеміологічного нагляду (спостереження) та профілактики неінфекційних хвороб
Відділ імунопрофілактики
Відділ моніторингу та реагування на небезпеки
Відділ комунікації та інформаційно-роз’яснювальної роботи
Відділ дослідження фізичних та хімічних факторів
Фінансово-економічний відділ
Відділ правового забезпечення
Відділ бухгалтерського обліку
Відділ кадрового забезпечення
Адміністративно-господарський відділ
Відділ організаційного забезпечення, документування і контролю
Санітарно-гігієнічна лабораторія
Радіологічна лабораторія
Бактеріологічна лабораторія